go kegg_GO和KEGG的绘图详解

1 什么是GO? 什么是KEGG?   GO(Gene Ontology,基因本体论)是基因本体论联合会建立的一个数据库,旨在建立一个适用于各种物种的、对基因和蛋白功能进行限定和描述的,并能随着研究不断深入而更新的语义词汇标准。GO注释分为三大类,分别是:分子生物学功能(Molecular Function,MF)、生物学过程(Biological Process,BP)和细胞学组分(Cellular Components,CC),通过这三个功能大类,对一个基因的功能进行多方面的限定和描述。 而KEGG(

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go分析和kegg分析_一些GO及KEGG分析的知识

什么是GO分析? Gene Ontology(简称GO)是一个国际标准化的基因功能分类体系,提供了一套动态更新的标准词汇表(controlled vocabulary)来全面描述生物体中基因和基因产物的属性。GO总共有三个ontology(本体),分别描述基因的分子功能(molecular function)、细胞组分(cellular component)、参与的生物过程(biological process)。GO的基本单位是term(词条、节点),每个term都对应一个属性。 什么是KEGG分析?

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r语言进行go富集分析_利用R语言绘制热图、韦恩图、GO富集分析图(有了转录组数据不知道该怎么写文章,看我就对了!)...

上个月我们曾经学习过一篇细胞内PD-L1调控RNA稳定性的文章:TCGA正常血液样本中PD-L1与BRCA1和NBS1的表达量相关性(没找到原数据,但重复出了结果)(PS,目前为止我还是没能找到TCGA中"Blood Derived Normal"样本的RNA-seq数据 ╯︿╰ ),当时文中Fig4的测序数据还没有公开,现在GEO上已经可以下载了,不过作者只提供了处理好的excel表格数据和RNA-seq raw-data,对处理RNA-seq raw data感兴趣的欢迎点击“阅读原文

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Go语言自学系列 | golang标准库log

视频来源:B站《golang入门到项目实战 [2021最新Go语言教程,没有废话,纯干货!持续更新中...]》 一边学习一边整理老师的课程内容及试验笔记,并与大家分享,侵权即删,谢谢支持! 附上汇总贴: Go语言自学系列 | 汇总_COCOgsta的博客-CSDN博客_go语言自学 log简介 golang内置了log包,实现简单的日志服务。通过调用log包的函数,可以实现简单的日志打印功能。 log使用 log包中有3个系列的日志打印函数,分别print系列、panic系列、fatal系列。 函数系列

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go开发工具goclipse的安装

(1) 安装Eclipse 建议下载Eclipse时直接下载“Eclipse IDE for Java Developers”的package,而不要下载较小的Installer。因为Installer在安装Eclipse时还要联网下载,因为***的原因,联网下载会非常慢甚至失败。 Eclipse package下载地址: http://www.eclipse.org/downloads/eclipse-packages/ (2) 安装GoClipse 可以采取在线安装的方式或离线的方式安装。 我采用在线

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golang 队列: gopkg.in/eapache/queue原理和使用方法

golang 队列: gopkg.in/eapache/queue 说明: 本文主要介绍golang queue 库: gopkg.in/eapache/queue 的实现原理和使用。 第三方开源库获取: go get gopkg.in/eapache/queue.v1 使用时导入: import "gopkg.in/eapache/queue.v1" 原理: 队列的缓存区为环形,实际是一个数组,当队头元素取出后,队头标志会往后移动,空出的位置可存储队尾新加元素,当队尾增加元素时,队尾标志

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Golang之工具包

go build (go语言编译命令)  这个命令主要用于编译代码。在包的编译过程中,若有必要,会同时编译与之相关联的包。 如果是 main 包,当你执行 go build 之后,它就会在当前目录下生成一个可执行文件。如果你需要在 $GOPATH/bin 下生成相应的文件,需要执行 go install 如果某个项目文件夹下有多个文件,而你只想编译某个文件,就可在 go build 之后加上文件名,例如 go build a.go ; go build 命令默认会编译当前目录下的所有go文件 参数的介绍

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【go】go类库-命令行工具cli

go类库:命令行工具cli 1-引入库:go get github.com/urfave/cli 2-code // main.go package main import ( "fmt" "os" "github.com/urfave/cli" ) func main ( ) { app := cli . NewApp ( ) app . Commands = [ ] cli . Command { { // 命令名称 Name : "test&#

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Golang常用工具类库

Go语言常用功能类库 Welcome! github地址如下,欢迎star fork commit. 代码传送门,快点击我 功能列表: 数据结构(collections/***) map 链式map(linkedhashmap: collections/map2/linkedhashmap.go) queue 优先级队列(collections/queue/priority_queue.go) set set(collections/set/set.go) 文件操作(utils/file/fileutil

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Leaf - 一个由 Go 语言编写的开发效率和执行效率并重的开源游戏服务器框架

转自:https://toutiao.io/posts/0l7l7n/preview Leaf 游戏服务器框架简介 Leaf 是一个由 Go 语言(golang)编写的开发效率和执行效率并重的开源游戏服务器框架。Leaf 适用于各类游戏服务器的开发,包括 H5(HTML5)游戏服务器。 Leaf 的关注点: 良好的使用体验。Leaf 总是尽可能的提供简洁和易用的接口,尽可能的提升开发的效率 稳定性。Leaf 总是尽可能的恢复运行过程中的错误,避免崩溃 多核支持。Leaf 通过模块机制和  leaf/go

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Golang手写RPC框架(day1)

Golang手写RPC框架(day1) 我的项目地址 包括项目源码和笔记内容。 Day1 服务端与消息编码 具体流程见 传送门 这里只介绍一下额外的细节和其他知识点。 1.多主程序项目的启动 Goland对于多主程序的项目,可以使用不同的配置来启动不同的项目。 build目录是 使用go build 后程序生成的exe可执行文件。 run是工作目录,可以进行额外的配置。(这里没有作用) 2.流程 这里说明主程序的流程。 在 startServer 中使用了信道 addr ,确保服务端端口监听成功,客户端再

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Golang快速开发框架搭建

GO 语言爱好者的最佳Web框架 如果你是自己写一个小应用程序,那你可能不需要Web框架。但是如果你要做产品,那么你肯定需要一个好的框架。 如果你认为你有相应的知识和经验,你会自己编写所有的这些代码么?你有时间找到一个产品级的外部包来完成工作吗?你确定这与你应用程序的其它部分一致吗? 这些都是促使我们(即便是我们中最优秀的)使用框架的原因,如果其他人已经做了必要的艰苦的工作,我们不会想让自己重复这些工作。 简介 Go 是一个快速增长的开源编程语言,用于构建简单、快速和可靠的软件。点这里看有哪些大公司在使用

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Golang专题——fsnotify 文件及目录监控

背景 我们总有这样的担忧:总有刁民想害朕,总有人偷偷在目录下删改文件, 高危操作想第一时间了解 ,怎么办? 而且通常我们还有这样的需求: 监听一个目录中所有文件,文件大小到一定阀值,则处理; 监控某个目录,当有文件新增,立马处理; 监控某个目录或文件,当有文件被修改或者删除,立马能感知,进行处理; 怎么解决呢?通常来说有三个办法: 第一种:当事人主动通知你,这是侵入式的,需要当事人修改这部分代码来支持,依赖于当事人的自觉;( ps.显然这不太可能 ) 第二种:轮询观察,这个是无侵入式的,你可以自己写个轮询

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golang学习笔记01——基本数据类型

基本类型 虽然从底层而言,所有的数据都是由比特组成,但计算机一般操作的是固定大小的数,如整数、浮点数、比特数组、内存地址等。进一步将这些数组织在一起,就可表达更多的对象,例如数据包、像素点、诗歌,甚至其他任何对象。Go语言提供了丰富的数据组织形式,这依赖于Go语言内置的数据类型。这些内置的数据类型,兼顾了硬件的特性和表达复杂数据结构的便捷性 基本数据类型 长度(字节) 默认值 说明 bool 1 false byte 1 0 byte是uint8的别名 rune 4 0 Unicode Code Poin

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Go 常用库

这里填写标题 1. Go 常用库 1.1. HTTP 1.1.1. goproxy: An HTTP proxy library for Go 1.1.2. go-retryablehttp 1.1.2.1. exponential backoff(指数退避) 1.1.3. go-dnscache 1.2. 替代库 1.2.1. 替代 git, go-git: A highly extensible Git implementation in pure Go. 1.3. 社交 1.3.1. 评论 1. G

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Go语言自学系列 | golang标准库os包进程相关操作

视频来源:B站《golang入门到项目实战 [2021最新Go语言教程,没有废话,纯干货!持续更新中...]》 一边学习一边整理老师的课程内容及试验笔记,并与大家分享,侵权即删,谢谢支持! 附上汇总贴: Go语言自学系列 | 汇总_COCOgsta的博客-CSDN博客 package main import ( "fmt" "os" "time" ) func main() { // 获得当前正在运行的进程id fmt.Printf("os.Gete

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eclipse离线安装windowbuilder_安装Golang开发环境(上)

Eclipse是一个老牌的开源开发工具,做java的朋友应该比较熟悉,没用过也听过它的大名。 以下是它的下载主页 https://www.eclipse.org/downloads/ 点击进入下载,有许多下载列表。当前是: 我们现在选择这个 Eclipse IDE for Enterprise Java Developers 格子使用的是windows系统,就下载.Windows 64-bit,当前版本号2020-06 然后网站会挑选一个离你最近的镜像进行下载。 下载后,解压就安装完成了。 首先添加cdt

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golang 常用库

html js渲染: webloop https://sourcegraph.com/github.com/sourcegraph/webloop/readme HTML解析库 http://www.oschina.net/p/goquery

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Golang第三方库汇总

【传送门】

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Golang控制台UI库 vfmt

vfmt Golang控制台UI库(基于 https://github.com/i582/cfmt 做的修改,主要修复了结构体输出样式失效、并行输出样式失效问题) USAGE import "github.com/vua/vfmt" //有内容有样式 output := "Console Output" style := "red" vfmt.Printf("[vfmt] @[%s::%s]\n", output, style) vfmt.P

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